La création du club remonte à 1912 (déclaration à la sous-préfecture de Guingamp le 22 décembre 1918, publication au Journal Officiel du 7 janvier 1919.
L'ère moderne du club débute en 1972 - 1973 avec l'accession de Noël LE GRAET à la présidence en juin 1972.
La fabuleuse épopée en Coupe de France (jusqu'en 8ième de finale) alors que le club est en DSR, il élimine successivement quatre clubs professionnels de deuxième division avant d'être écarté par Rouen. Le Match aller s'est déroulé à Rennes devant 27000 spectateurs.
La première saison en deuxième division se situe en 1977 - 1978.
Le statut professionnel est adopté en 1984.
Noël LE GRAET quitte la présidence du club le 23 septembre 1991 (le club dispute sa 15ième saison consécutive en DII) et est élu président de la Ligue Nationale de Football le 19 octobre 1991.
Bertrand SALOMON est élu président le 23 septembre 1991.
Après un passage à vide lors de la saison 1993 - 1994 avec une descente en national 1, En Avant remonte en DII en 1994 - 1995 puis dispute 3 saisons en division 1, 95/96, 96/97, 97/98. Le club connaît un parcours exceptionnel : Coupe Intertoto, Coupe UEFA, Finale de la Coupe de France.
Bertrand SALOMON démissionne le 4 novembre 1998, Alain AUBERT est élu président le 20 novembre 1998.
Le départ de Francis SMERECKI intervient le 15 février 1999, il est remplacé par Guy LACOMBE.
En Avant retrouve la première division en mai 2000 et termine la saison 2000-2001 à une très honorable dixième place, juste derrière le PSG.
La saison 2001-2002, à l'issue de laquelle Guingamp obtient in-extremis son maintien au bénéfice d'une victoire lors de la dernière journée contre Troyes, sera suivie de grands bouleversements au sein de la hiérarchie du club. Alain AUBERT cède sa place à la présidence du club à Noël LE GRAËT.
Guy LACOMBE quitte quant à lui les Côtes-d'Armor pour aller entraîner le FC Sochaux. Il est remplacé à son poste par Bertrand MARCHAND. Plusieurs cadres (Guyot, Guivarc'h, Tasfaout) de l'équipe quittent le club. C'est le début d'un nouveau cycle.
La saison 2002/2003 restera l'une des plus belles de l'histoire du club. Guingamp se classe 7ème du championnat.
La saison 2003/2004 aura une triste fin. En Avant quittera l'élite à l'issue de la dernière journée, battu à Marseille, et descendra en Ligue 2.
Yvon Pouliquen succède à Bertrand Marchand au poste d'entraîneur. En Avant terminera 7ème du Championnat de Ligue 2 la saison 2004/2005.
La saison 2005/206 démarre mal et dès le mois de septembre, Yvon Pouliquen est remercié. Alain Ravera prend alors les comandes de l'équipe et l'EAG termine 9ème du Championnat.
En 2006/2007, la direction de l'équipe a été confiée à Patrick Rémy, assisté sur le banc par Claude Michel.
En septembre 2007, les mauvais résultats d'En Avant ont vu le remplacement de P.Rémy par Victor Zvunka.